Documentation
La sección de documentación estará en desarrollo durante un buen tiempo y se irá liberando nueva información con el paso del tiempo. Podrás acceder a la documentación publicada en este github pages en cualquier momento.
La información por el momento solo estará disponible en idioma español.
Introducción a R
La idea de este curso es complementarlo según cuántas cosas nuevas vaya aprendiendo. Por ahora me centraré en lo que he dominado.
¿Cuál es el objetivo de este curso?
Aprender juntos y funcionar como una herramienta básica para cualquier biólogo que desee una herramienta de fácil acceso para R. Los biólogos en la Universidad del Cauca a pesar de que tenemos un acercamiento importante a varios programas estadísticos no llegamos a tener un nivel de profundización en los lenguajes de programación, por ello, mi idea frente a ello nace con esta guía.
Descargando R y RStudio - Primero accede al siguiente enlace “Descargar R” y “Descargar R Studio”
Si no tienes Windows dirígete al siguiente enlace “Descargar R según la versión”
Para descargar Rstudio
“Descargar RStudio para otros SO”
Diferencias entre usar la consola y la zona de script
La consola es uno de los apartados en donde se escribe
Ejercicios Importanción y manejo de datos
En esta sección encontrará los descargables para el desarrollo de su práctica. Esta secicón aún se encuentra en desarrollo por favor tener paciencia.
Para acceder al archivo preeliminar dirígirse a este enlace
gene_datase.
Además podrá acceder a una versión cambiada y adaptada para propósitos del ejercicio:
gene_datase_reorganized.xlsx
Una versión sin orientación de un documento obtenido en GREIN : GEO RNA-seq Experiments Interactive Navigator
En el siguiente enlace podrá acceder a diferentes metadatos de RNA-seq según su interés, si los usa deberá citarlos
Para acceder ingrese a :GREIN : GEO RNA-seq Experiments Interactive Navigator
Referencias
Melbourne Bioinformatics. (2023) R for biologists GitHub